La Sanidad Militar promueve y protege la salud del personal del Ejército. Con en ese fin, cumple una variedad de funciones, entre las que se destacan:
El fomento de la medicina preventiva, la higiene y el saneamiento ambiental.
El reconocimiento médico, la atención primaria, el diagnóstico, la rehabilitación y el tratamiento.
La rehabilitación física y psiquiátrica de aquellos veteranos de guerra que lo necesiten.
La instrucción y capacitación profesional del personal de la salud.
El fomento de la investigación y el desarrollo a fin de lograr nuevas técnicas y procedimientos en la elaboración de medicamentos.
El trabajo integrado con el sistema de Vigilancia Epidemiológica Nacional.
La Sanidad Militar también proporciona apoyo a la comunidad poniendo a disposición personal, infraestructura y medios para atender a los damnificados de desastres naturales y emergencias sociales; asimismo, participa en campañas destinadas a controlar y erradicar enfermedades endémicas y epidémicas de repercusión social, y contribuye al sostenimiento de la actividad antártica nacional y a la conservación del medio ambiente y mantenimiento del sistema ecológico mediante acciones de saneamiento ambiental.